国际上目前还没有有效地清除HPV病毒的治疗药物上市，感染了高危型HPV，临床上仍然不治疗，采取随访观察、等待自愈的办法。

        国内应用于临床的治疗方法分三类，（1）仿制清除HIV病毒的方法。但是HIV与HPV是完全不同的两类病毒，其宿主细胞、受体及复制程序均不同。该类产品的有效性值得磋商。（2）扩展中药的适应症。HPV病毒感染预防的前提是未感染，病毒均处于单一感染阶段。治疗感染时，病毒则处于多种不同感染阶段，有的是完整的颗粒病毒，有的是病毒DNA片段。有的在细胞外，有的已进入细胞内。清除HPV病毒感染，首先是杀灭，之后才是防护。中药迄今为止还没有直接杀灭 HPV 病毒的药效鉴定。（3）延续传统技术（调pH,烧灼）。采用化学或物理方法去掉黏膜上皮，即去掉了HPV病毒的宿主细胞，暂时是可以使HPV感染转阴，但是该类方法的缺点是：去掉黏膜上皮后，导致基底细胞暴露，使人体更易感染HPV病毒。